AI for Science · Materials · Bio · Virtual Cells
Shuizhou Chen
陈水洲
Hi 大家好，我是上海大学计算机工程与科学学院硕博连读研究生，曾在MicroSoft AI for Science，现于上海ai lab实习，方向为AIVC（虚拟细胞），热衷于研究新的ai技术，和新的生物科技 当前研究聚焦于Diffusion Models、Diffusion LM、Unified Foundation Models，Graph Foundation Models、多模态表示与对齐， 以及它们在 AIVC、材料与分子逆向设计、动态模拟中的应用。欢迎对相关内容感兴趣的朋友联系。
GNN
Diffusion Models
Graph Foundation Models
AIVC
Materials & Molecules
Multimodal Alignment
邮箱
shuizhou@shu.edu.cn
电话
(+86) 13207120996
当前身份
Shanghai University · PhD Track Student
最新动态
最近主要专注于基于 Diffusion Models 与 Graph Foundation Models 的多尺度建模，推进 AIVC（虚拟细胞）与材料/分子逆向设计方向的研究和落地。
2025.11 – 至今：上海人工智能实验室（AIVC 虚拟细胞大模型研发）
2025.09 – 2025.10：上海人工智能实验室（材料势函数建模、深度学习算法研发）
2024.02：Microsoft AI4Science “明日之星”项目研究实习完成
近期成果
🏆 Kaggle Competition Expert
Top 2%
Top 2%
📋 已公开专利
1 项
1 项
🔐 软件著作权
3 项
3 项
荣誉与资质
上海大学国家奖学金（2022）
英语六级 607 分
上海大学计算机学院学业奖学金第一名（2022）
教育经历
上海大学 · 上海
硕博连读研究生，计算机工程与科学学院
导师：钱权教授
2021.09 – 至今
科研经历
东京大学 · 日本
境外合作研究（几何深度学习方向）
Mentor：Ichigaku Takigawa 教授（东京大学）
- 参与日本 JSPS KAKENHI 国际合作项目 (Grant: 24K23848, 25K03174)
- 围绕材料/催化性质预测中的几何深度学习与领域模型开展研究。
2025.03 – 至今
上海人工智能实验室
生命科学大模型实习生（虚拟细胞方向）
Mentor：孙思琦老师，高张阳老师
- Virtual Cell Research：建模 control / pert 基因转录组中的扰动问题。
- 设计 conditional flow model，拟合特定条件下 control 组细胞到 pert 状态的群体迁移。
2025.11 – 至今
上海人工智能实验室
材料科学大模型实习生（势函数方向）
Mentor：郝红霞老师
- 以 E2Former 为基线开发新型深度学习势函数算法。
- 在球谐卷积基础上引入 Graph Transformer 与平滑函数设计，在保持速度的前提下提升预测性能。
2025.09 – 2025.10
Microsoft AI4Science
明日之星项目研究实习生
Mentor：Dr. Hongxia Hao, Dr. Han Yang, Dr. Ziheng Lu and Dr. Haiguang Liu
- MatterGen：面向固体周期性材料逆向生成，参与 diffusion score-based model 设计与 conditional generation block 开发。
- MatterSim：参与极端条件下合金材料势函数建模、MP 数据预训练与微调、fine-tuning 与 train-from-scratch 横向比较及论文撰写。
2023.07 – 2024.02
科研项目与合作经历
国家重点研发项目《材料基因工程专用数据库平台建设与示范应用》
算法研发成员
为平台设计并集成机器学习算法和材料逆向设计相关功能。
2021 – 2022
云南省重大科技专项《云南省稀贵金属材料基因工程（一期 2020）》
算法研发成员
实现集成机器学习方法与部署等工作。
2021 – 2022
云南省重大科技专项《云南省稀贵金属材料基因工程（二期 2023）》
算法研发成员
设计以 GPT 为导向的材料类 LLM 架构并落地 Material GPT。
2023 – 至今
"十四五"国家重点研发计划"增材制造与激光制造"专项
技术骨干
参与“同/异质 SiCp/Al 复合材料构件激光智能焊接技术与装备”项目及焊接全生命周期数据库与数据挖掘工作。
2023 – 至今
重点新材料研发及应用国家科技重大专项《海量多源异构材料数据质量分级与全生命周期质量评价技术》
技术骨干及核心成员
参与项目申请、落地和相关研究；项目申请阶段材料撰写贡献学生顺位第一。
2024.06 – 至今
日本 JSPS KAKENHI 国际合作项目
合作单位：东京大学、北海道大学 WPI-ICReDD、RIKEN
围绕材料/催化/化学性质预测中的几何深度学习与领域模型开展研究，参与方法设计、实验分析与论文撰写。Grant Number: 24K23848, 25K03174.
2025.03 – 至今
发表
† indicates equal contributions
Shuizhou Chen, He Cao, Qiubao Ouyang, Xing Wu, Quan Qian.
"ALDS: An active learning method for multi-source materials data screening and materials design".
Shuizhou Chen, Chenghan Sun, Zhiyuan Liu, Andi Han, Ichigaku Takigawa, Quan Qian.
"CompGen: A Conditional Generation Framework for Inverse Composition Design of Catalytic Surfaces".
Shuizhou Chen, Yuchao Tang, Wenbin Ye, Yi Liu, Quan Qian.
“Beyond global: 3D Equivalent Local Augmentation Deep Graph Neural Networks for Formation Energy Prediction on Doping Crystal Structure”.
Shuizhou Chen, Lidong Chen, Lyuwen Fu, Bili Xu, Jiong Yang, Yunhua Yang, Tong-Yi Zhang, Quan Qian, Wei Xie.
“PolyX: AI-Driven Polyimide Design with Hybrid GNN-Transformer Frameworks”.
Shuizhou Chen†, Lidong Chen†, Quan Qian, Wei Xie.
“Segment Mask Attention GNN: an exclusive Graph Transformer for polymer representation”.
Han Yang†, Chenxi Hu†, Yichi Zhou†, Xixian Liu†, Yu Shi†, Jielan Li†, Guanzhi Li†, Zekun Chen†, Shuizhou Chen†, et al.
"MatterSim: A Deep Learning Atomistic Model Across Elements, Temperatures and Pressures".
Jielan Li, Zekun Chen, Qian Wang, Han Yang, Ziheng Lu, Guanzhi Li, Shuizhou Chen, et al.
"Probing the Limit of Heat Transfer in Inorganic Crystals with Deep Learning".
Chenghan Sun†, Shuizhou Chen†, Zekun Chen†, Wang-Yeuk Kong, Ichigaku Takigawa.
“Comparative Analysis of Domain-Specific and Geometric Deep Learning Models in Chemical Property Predictions”.
Xu P, Chen C, Shuizhou Chen, et al.
"Machine learning-assisted design of yttria-stabilized zirconia thermal barrier coatings with high bonding strength".
Yuchao Tang, Bin Xiao, Shuizhou Chen, Quan Qian, Yi Liu.
"Predefined attention-focused mechanism using center-environment features: a machine learning study of alloying effects on the stability of Nb5Si3 alloys".
SCALE: Scalable Conditional Atlas-Level Endpoint Transport for Virtual Cell Perturbation Prediction.
陈水洲，王晓书，欧阳求保，张瑞。《数据驱动的铝基复合材料性能预测和逆向设计》。
竞赛经历
Kaggle 竞赛
NLP 类比赛两次银牌，CV 类比赛一次银牌。
NLP 类比赛两次银牌，CV 类比赛一次银牌。
Jigsaw Rate Severity of Toxic Comments
评论间相似度排序，baseline 使用 Ridge + fastText + Improved RoBERTa。
评论间相似度排序，baseline 使用 Ridge + fastText + Improved RoBERTa。
CommonLit Readability Prize
文本分类任务，评定 3–12 年级课堂使用的文学段落复杂程度。
文本分类任务，评定 3–12 年级课堂使用的文学段落复杂程度。
RANZCR CLiP - Catheter and Line Position Challenge
医学影像任务，设计多模态混合 CV 框架，利用混合 loss 训练完成分类。
医学影像任务，设计多模态混合 CV 框架，利用混合 loss 训练完成分类。
阿里天池大数据竞赛全球人工智能技术创新大赛（赛道一）
2021 · 银牌（NLP 方向）
2021 · 银牌（NLP 方向）
全国大学生英语竞赛
三次获奖：两次三等、一次二等奖
三次获奖：两次三等、一次二等奖
技术技能
ML / DL
熟练使用常规机器学习与深度学习技术。
熟练使用常规机器学习与深度学习技术。
GNN
熟悉图表征、几何图深度学习、图生成模型及科学计算中的图算法应用；熟悉 ESEN、Eqv2 等势函数类型。
熟悉图表征、几何图深度学习、图生成模型及科学计算中的图算法应用；熟悉 ESEN、Eqv2 等势函数类型。
Diffusion
熟练使用 DDPM、SDE、Bridge model 等方法，关注 conditional generation 与 geometry 结合。
熟练使用 DDPM、SDE、Bridge model 等方法，关注 conditional generation 与 geometry 结合。
LLM
熟练使用 Adapter、LoRA 等微调技术，熟悉 Megatron、SFT、RLHF、多模态对齐与 Agent 相关技术。
熟练使用 Adapter、LoRA 等微调技术，熟悉 Megatron、SFT、RLHF、多模态对齐与 Agent 相关技术。